波士顿学院的哲学硕士课程为学生提供了加深他们对哲学史的认识的机会，并开展多种主题的工作，例如亚里士多德自然主义，中世纪语言理论，康德空间和时间观，理论种族，以及科学，伦理，法律和宗教交叉的当代辩论。这些课程的一个重要特点是每学期为研究生提供广泛而多样化的课程。它们涵盖了哲学的历史和问题，可以集中在以下领域：古代哲学，中世纪哲学，现代哲学，现象学和当代大陆哲学，伦理学，社会和政治哲学，法哲学，宗教哲学，认识论和哲学科学。该部门与Lonergan研究所等研究中心相连，并且是几个学术期刊的所在地。该部门的成员在国内和国际上都知名，并参与前沿研究。此外，该部门每年都会有许多来自美国和国外的演讲者（通过自己的讲座系列，或者像古代哲学中的波士顿地区学术讨论会这样的联合会），并邀请一位杰出的学者担任伽达默尔访问教授并教授四人六个星期。此外，学生可以在波士顿学院的其他部门（例如，政治学，神学）参加适当的研究生课程，并且可以利用波士顿学院参与波士顿地区联盟的波士顿更广泛的知识产权，这使他们能够跨越波士顿学院。在波士顿大学，塔夫斯大学或布兰迪斯大学注册每学期一门课程。通过申请，他们还可以参加妇女研究研究生联合会和波士顿神学院。